萬大發電廠位於知名風景區碧湖(霧社水庫,也有人稱為萬大水庫)的南邊,廠區深藏在濁水溪曲繞的山嶺台地上,萬大溪在此流過,將電廠分為兩部分,中間有鐵橋和隧道相連,路旁即是飄著濃濃日本味的台電萬大發電廠員工日式宿舍區,以及原住民聚落。